长期守候在本庄医院第一线的内科医生栗原一止（樱井翔 饰），即将和妻子榛名（宫崎葵 饰）迎接新生命的到来，但是工作和家庭间的矛盾也让他的内心升起隐隐的忧虑。与此同时，一止的医科大同学近藤辰也（藤原龙也 饰）作为血液科精英来到本庄医院。一止兴奋非常的同时，却发现曾经善良敬业的近藤变得冷漠无情。另一方面，常年驻守医院的恩师贯田诚太郎（柄本明 饰）突然病倒，很快便被诊断患有晚期淋巴癌。曾经为了医患牺牲家庭的贯田医生，总算迎来了和夫人千代（市毛良枝 饰）相守的短暂而珍贵的时光。医疗改革让病患们得到无微不至的关怀，但作为人而存在的医生则为此付出了更多、更多……本片根据夏川草芥的同名原作改编。
《神的病历簿2》延续了前作温暖细腻的叙事风格，却以更尖锐的矛盾叩击着医者的精神世界。樱井翔饰演的栗原一止不再是那个在山间诊所怡然自得的“老派医生”，当昔日挚友近藤辰也骤然出现时，他平静的生活被撕开一道裂缝——两人对医疗本质的分歧如同两股暗流，在雪山疗养院与都市医院的对照中激烈碰撞。
宫崎葵的表演堪称全片灵魂。她饰演的栗原榛名既是观察者又是参与者，那双总是含着水汽的眼睛，既映出丈夫深夜独坐书桌前的疲惫身影，又捕捉到患者家属隐忍的悲痛。尤其在一场手术室外的戏份中，她攥紧围裙的手指微微发颤，却始终用平稳的语气安抚哭泣的孩童，这种克制的力量感令人心折。而藤原龙也塑造的近藤医生带着某种近乎偏执的锐利，当他在学术会议上拍案而起痛斥体制弊端时，脖颈暴起的青筋与镜片后泛红的眼眶，将理想主义者的挣扎演绎得极具说服力。
导演深川荣洋采用双线并行的叙事结构堪称妙笔。一条线索跟随栗原在诊疗室与病房间的奔波日常，另一条则延伸至近藤所在的大学医院科研战场。两条时空交错的故事最终在暴风雪夜交汇——栗原为守护临终患者选择放弃抢救设备，而近藤正为争取新型抗癌药物审批通过据理力争。此刻镜头交替切换两人在各自战场上的身影，漫天飞雪成了最纯净的背景幕布。
影片最动人之处在于它拒绝给出标准答案。当年轻实习医生质问“究竟怎样才算好医生”时，栗原沉默良久后的回答堪称经典：“不是成为神，而是学会在有限的生命里种下希望。”这句台词恰似整部作品的注脚——没有刻意升华的说教，只有透过听诊器传递的温度，以及病历簿上密密麻麻记录的人性微光。